语言模型能否推理结合分子？空间约束下的 LLM 基准评测

基于结构的药物设计（SBDD）利用蛋白质靶点3D结构并辅以空间约束来生成候选结合分子。扩散模型在高质量3D分子生成中占据主导，但基于LLM的方法正在兴起并展现竞争力。然而，当前LLM对物理和3D空间的推理能力仍缺乏系统评测。本工作系统分析了通用LLM是否具备相应的能力。